產(chǎn)品描述
ATAC-Seq技術(shù)的原理是通過轉(zhuǎn)座酶Tn5容易結(jié)合在開放染色質(zhì)的特性，然后對(duì)Tn5酶捕獲到的DNA序列進(jìn)行測(cè)序。DNA轉(zhuǎn)座，是一種把DNA序列從染色體的一個(gè)區(qū)域搬運(yùn)到另外一個(gè)區(qū)域的現(xiàn)象，由DNA轉(zhuǎn)座酶來實(shí)現(xiàn)。這種轉(zhuǎn)座插入DNA，也是需要插入位點(diǎn)的染色質(zhì)是開放的，否則就會(huì)被高級(jí)結(jié)構(gòu)給卡住。
轉(zhuǎn)座酶可以隨機(jī)結(jié)合并切割染色質(zhì)開放區(qū)的DNA，并且可同時(shí)在切割位點(diǎn)插入接頭序列。如下圖，只要將攜帶已知DNA序列標(biāo)簽的轉(zhuǎn)座復(fù)合物（即帶紅色和藍(lán)色序列標(biāo)簽的Tn5轉(zhuǎn)座酶）加入到細(xì)胞核中一起孵育，再利用已知序列標(biāo)簽進(jìn)行PCR擴(kuò)增即可形成文庫，經(jīng)過測(cè)序就可以獲得染色質(zhì)開放區(qū)的信息。
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
1、靈敏度高,細(xì)胞起始量低；
2、操作更簡(jiǎn)單，優(yōu)化建庫、耗時(shí)短；
3、技術(shù)重復(fù)性強(qiáng)、成功率高;
4、檢測(cè)基因組組蛋白修飾、轉(zhuǎn)錄因子、轉(zhuǎn)錄調(diào)控子結(jié)合位點(diǎn)；
5、分析結(jié)果可視化，圖形化的展示peak的富集情況
實(shí)驗(yàn)流程
數(shù)據(jù)分析
| 樣本類型 | 建議送樣量 | 存儲(chǔ)介質(zhì) | 保存、運(yùn)輸條件 |
| 凍存細(xì)胞 | >20 w | 1.將細(xì)胞重懸與凍存液(50% FBS+40%完全培養(yǎng)基+10% DMSO)中,每個(gè)凍存管加入≥20萬細(xì)胞 2.將凍存管（標(biāo)記樣本名）放入程序降溫盒中，放入-80度冰箱，降溫6-24H后即可準(zhǔn)備運(yùn)輸 | -80℃冰箱保存，干冰運(yùn)輸 |
| 新鮮細(xì)胞 | >10 w | 10%FBS常用培養(yǎng)基 | 運(yùn)輸時(shí)使用碎冰4°運(yùn)送，新鮮細(xì)胞懸液盡可能在4h內(nèi)送達(dá) |
| 動(dòng)物組織 | >30 mg | / | 液氮速凍30min 后放于-80℃保存；干冰運(yùn)輸 |
| 植物 | 葉片≥0.5g；莖≥1 g；根≥1 g | / | 液氮速凍樣本，然后用預(yù)冷的錫箔紙包裹儲(chǔ)存在-80°C，干冰運(yùn)輸 |
研究方向/思路
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